Oferta Predoctoral -Ecología Microbiana – Universidad País Vasco
¿Quieres contribuir a Salvar la abeja melífera?
Buscamos candidato/a predoc
Se busca candidato/a para realizar la Tesis Doctoral titulada “Análisis de la diversidad microbiana y genómica de Apis mellifera en entornos y manejos diversos para desentrañar los factores bióticos y abióticos que favorecen la resistencia al ácaro varroa.”
Esta tesis está enmarcada en el proyecto ECOAPI, financiado por el Ministerio de Ciencia e Innovación en la convocatoria ”Proyectos estratégicos orientados a la Transición ecológica y digital”. El proyecto contempla la financiación para un/a estudiante predoctoral durante un año prorrogable. Además, en la convocatoria 2024 se solicitará una Beca Predoctoral (UPV/EHU o Gobierno Vasco) de 4 años.
Durante la tesis, el/la estudiante se incorporará al grupo de investigación Applied Genomics and Bioinformatics con más de 20 años de dedicación al estudio genético de la abeja melífera (Catedrática de genética Andone Estonba, ORCID: 0000-0003-2851-5201). El/la estudiante estará guiada por un investigador postdoctoral implicado en el proyecto, y tendrá la oportunidad de colaborar con investigadores de institutos y universidades europeas prestigiosas, lo que facilitará estancias en el extranjero y obtener la mención de tesis internacional. La tesis estará dirigida por la Dra Iratxe Zarraonaindia (especializada en ecología microbiana, ORCID: 0000-0002-0615-0187) y la Dra Melanie Parejo (especializada en genómica de poblaciones de abejas, ORCID: 0000-0002-7248-0424).
BREVE DESCRIPCIÓN:
El ácaro Varroa destructor y sus virus asociados son la causa de cuantiosas pérdidas anuales dentro del sector apícola a nivel mundial. Para reducir el uso de tratamientos químicos contra la varroasis, el objetivo principal del proyecto ECOAPI es proporcionar soluciones apícolas alternativas y sostenibles basadas en la selección de abejas resistentes a la varroa. Concretamente, en ECOAPI (1) evaluaremos los niveles de infestación de varroa en diferentes poblaciones de Apis mellifera de la península ibérica, así como parámetros de producción y salud de las colmenas, y (2) nos proponemos esclarecer la contribución de diversos factores (ambientales, genómicos, microbianos y víricos) así como de los mecanismos (inmunidad social, manejo, etc.) que proporcionan una mayor resistencia y supervivencia de la abeja melífera frente a la varroa.
TRABAJO A REALIZAR:
- Colaborar en el trabajo de campo: recogida de muestras y mediciones en el colmenar (abundancia de varroa, productividad etc).
- Evaluación de parámetros de resistencia en el laboratorio
- Procesamiento de muestras dirigido a la secuenciación masiva (NGS) (Hiseq, NovaSeq, PacBio etc.) de las comunidades microbianas y de la abeja melífera
- Procesamiento bioinformático de secuencias NGS genómicas y metagenómicas e integración con metadatos (datos ambientales, de producción, supervivencia y salud)
REQUISITOS:
- Titulación Universitaria en Biología, Bioquímica, Biotecnología, Ciencias ambientales, o similar, obtenida en junio 2017 o posterior
- Haber realizado el máster de investigación, o estar cursándolo durante el año académico 2023
- Expediente académico competitivo y nivel medio/alto de Inglés
DESTREZAS:
- Habilidades para el trabajo en equipo, actitud proactiva, iniciativa y autonomía
- Se valorará experiencia previa en laboratorio molecular y/o en bioinformática (Unix, R similar)
FECHA DE INICIO: INMEDIATA
Interesado/as enviar CV a iratxe.zarraonaindia@ehu.eus
